Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms