Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms