Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLCC1Q96S66 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms