Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms