Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms