Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC38A2Q96QD8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms