Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORCS2Q96PQ0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms