Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC7Q96NW7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms