Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms