Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms