Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms