Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf72Q96LT7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms