Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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