Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PGBD1Q96JS3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PGBD1Q96JS3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PGBD1Q96JS3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PGBD1Q96JS3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PGBD1Q96JS3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms