Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms