Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms