Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms