Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms