Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms