Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED12Q93074 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED12Q93074 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MED12Q93074 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MED12Q93074 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED12Q93074 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED12Q93074 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED12Q93074 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED12Q93074 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED12Q93074 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED12Q93074 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms