Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms