Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIFAP3Q92845 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms