Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSMEM1Q8WWF3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms