Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW6

OTOS, Otospiralin, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOSQ8NHW6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms