Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms