Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF397Q8NF99 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF397Q8NF99 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms