Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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