Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms