Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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