Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS37DQ86XT2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms