Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8AQ86V59 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms