Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms