Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms