Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRINP3Q76B58 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms