Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAD11Q709F0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms