Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms