Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TPTE2Q6XPS3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPTE2Q6XPS3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPTE2Q6XPS3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPTE2Q6XPS3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPTE2Q6XPS3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms