Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWW0

LCN15, Lipocalin-15, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN15Q6UWW0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN15Q6UWW0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN15Q6UWW0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN15Q6UWW0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN15Q6UWW0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LCN15Q6UWW0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN15Q6UWW0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LCN15Q6UWW0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LCN15Q6UWW0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LCN15Q6UWW0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN15Q6UWW0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN15Q6UWW0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN15Q6UWW0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN15Q6UWW0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN15Q6UWW0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCN15Q6UWW0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LCN15Q6UWW0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LCN15Q6UWW0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LCN15Q6UWW0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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LCN15Q6UWW0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LCN15Q6UWW0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LCN15Q6UWW0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LCN15Q6UWW0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LCN15Q6UWW0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LCN15Q6UWW0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LCN15Q6UWW0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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