Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6Q795 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6Q795 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6Q795 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6Q795 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6Q795 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6Q795 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6Q795 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6Q795 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms