Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC137Q6PK04 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms