Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms