Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ETFRF1Q6IPR1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms