Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms