Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf140Q5VVS0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms