Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms