Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHYHD1Q5SRE7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms