Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF628Q5EBL2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF628Q5EBL2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms