Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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C9orf116Q5BN46 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf116Q5BN46 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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