Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms