Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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